日本ウイルス学会はウイルス学および関連領域の発展に寄与することを目的としており、その達成のために国内における関係諸機関、諸学会との連絡や海外の関係学会等の諸団体との国際的な活動ならびに連絡を行うことを使命としています。
このため、日本ウイルス学会で使用するウイルス名は、内外の関係機関、関係学会等で一般的に使用されている名称を用いることを基本方針としています。